Darling in the Franxx is set in a dystopian future where children are artificially created and indoctrinated solely to defend the remnants of civilization. The story follows a squad of ten pilots, particularly focusing on the partnership between Hiro, a former prodigy, and Zero Two, a hybrid human and elite pilot who aspires to become entirely human.

故事發生在遙遠的未來。由於人類過度開採地球資源，地球變得荒蕪而不再適合人類居住。人類在尋找新能源時發現了「熔岩燃料」，但「熔岩燃料」的開採會吸引來半機械生命體「叫龍」（叫竜（きょりゅう））的攻擊。為對抗叫龍，倖存的人類發明了人形戰鬥機甲「FranXX」，並將男孩和女孩訓練成「操縱者」（パラサイト，Parasite），配成一對共同駕駛 FRANXX 與叫龍作戰。其中一名男孩廣在過去被視為神童。但他在一次失敗後變得無法駕駛 FRANXX，這讓他失去生存的欲望，直到他遇見一位名叫「02」的女性操縱者...

*該版本將兩卷內容合並為了一卷。