高中二年級學生高遠伊織，在上學途中等紅綠燈時，為了保護衝到貨車前面的少女而被車撞上。雖然被路過的科學家草薙結女所救，但醒來後原本高中男生的身體卻被改造成小學一年級的少女。到取回原本身體之前，伊織改以小學生高遠伊織的身分，開始到小學上學。