2015年。示巴所觀測到的未來領域毫無前兆地消失。根據計算，发現——不，是證明了人類將於2017年滅絕。人理延續保障機構·迦勒底將“無法觀測的領域”假定為人類滅絕的原因，決定執行尚處於試驗階段的第六實驗。那就是回到過去的時間旅行。將術者靈子化送往過去，通過介入事象，尋找出時空奇點，究明真相或予以破壞的禁斷的儀式。其名為聖杯探索——冠位指定（Grand Order）。